Para poder establecer estrategias de conservación de la biodiversidad, es importante primero saber qué existe. Es por esto que en el Jardín Botánico Haravéri se han realizado exploraciones con la finalidad de catalogar toda la flora que lo habita. Como resultado, se han registrado 454 especies en 279 géneros y 100 familias. De este total, 174 especies son nuevos registros para el municipio de San Sebastián del Oeste, 24 son especies endémicas de Jalisco y 8 son especies que no se conocían en el estado. Además, el jardín resguarda 12 especies protegidas por la NOM-059, 26 especies que se encuentran en alguna categoría de riesgo de la IUCN y 40 especies citadas en el apéndice 2 de CITES.